|
Bitki doku kültürü; aseptik şartlarda,
yapay bir besin ortamında, bütün bir bitki, hücre (meristematik
hücreler, süspansiyon veya kallus hücreleri), doku (çeşitli
bitki kısımları=eksplant)
veya organ (apikal meristem, kök vb.) gibi bitki kısımlarından
yeni doku, bitki veya bitkisel ürünlerin (metabolitler gibi)
üretilmesidir. Yeni çeşit geliştirmek ve mevcut çeşitlerde
genetik varyabilite oluşturmak doku kültürünün temel amaçları
arasında sayılabilir. Bu nedenle bitki doku kültürleri
genetiksel iyileştirme çalışmalarında önemli bir rol
oynamaktadır. Ayrıca kaybolmakta olan türlerin korunmasında ve
çoğaltılması zor olan türlerin üretiminde, çeşitli doku kültürü
yöntemleri rutin olarak uygulanmaktadır (Babaoğlu ve ark., 2001-Bitki
Biyoteknolojisi Cilt I-Doku Kültürü ve Uygulamaları- Bölüm 1.
Temel Laboratuvar Teknikleri).
Bitki doku kültürü işlemlerinde ve genetik iyileştirmelerde kullanılan temel sistem bitki rejenerasyonu yani bitkinin hücre, doku ve organlarından klonlanmasıdır. Bitki rejenerasyonu, kültürü yapılan hücrelerin özellikleri itibariyle üç kısımda incelenebilir; 1) organize olmuş meristematik hücreleri ihtiva eden somatik dokulardan rejenerasyon, 2) meristematik olmayan somatik hücrelerden rejenerasyon ve 3) mayoz bölünme geçirmiş gametik hücrelerden rejenerasyon. Birinci tip rejenerasyonda uç ve yan meristemlerden bitkiler çoğaltılır. Buna meristem kültürü yoluyla klonal çoğaltım denilir. Elde edilen hücreler tamamen donör (verici) bitkiye benzerler. İkinci tip rejenerasyon; doğrudan bir bitki parçasının (eksplant denilir) kesilmiş yüzeylerindeki belirli somatik hücrelerin bir kısmının genellikle besin ortamına ilave edilen bitki büyüme düzenleyicilerinin (özellikle oksin ve sitokininler) etkisiyle bölünerek ve organize olarak, organları ve daha sonra da bitkiyi (direkt organogenesis) veya bir somatik hücrenin sürekli bölünerek embriyo ve daha sonra da tam bir bitkiyi oluşturması (direkt somatik embriyogenesis) şeklinde olabilir. Ayrıca her iki durum, belirli bir kallus, proto-kallus veya hücre süspansiyonu oluşumu devresinden sonra da ortaya çıkabilir (indirekt rejenerasyon). Ortaya çıkan bitkilerde bazı kalıtsal veya geçici varyasyonlar oluşabilir. Son olarak normal kromozom sayısının yarısını ihtiva eden hücrelerden de direkt veya dolaylı yollarla bitki rejenerasyonu olabilir. Bu durumda donör bitkinin kromozom sayısının yarısına sahip, genellikle steril olan haploid bitkiler elde edilebilir. Bu bitkicik, doku veya hücrelerde kromozom katlaması yoluyla fertil (dihaploid veya katlanmış haploid) bitkiler elde edilir.
Tablo: Bitki doku kültüründe önemli çalışmalar (Pierik, 1993; Kung, 1993; Endress, 1994).
Babaoğlu ve ark., 2001-Bitki
Biyoteknolojisi Cilt I-Doku Kültürü ve Uygulamaları- Bölüm 1.
Temel Laboratuvar Teknikleri).
Bitki doku kültürlerinin bitki ıslahındaki uygulama alanları
Türler arası melezlemelerden sonra embriyo kültürü:
Zigot oluşumundan sonra ortaya çıkan (post-zigotik)
uyuşmazlıklar in vivo
melezlemelerde embriyo oluşumunu veya oluşan embriyoların
yaşamalarını engellemektedir. Bu embriyolar özel besin
ortamlarında doku kültürü ile geliştirilmekte ve yeni melez
bitkiler elde edilebilmektedir. Bu tekniğe embriyo kurtarma
tekniği denilmektedir (bkz. Bitki Biyoteknolojisi Cilt I, Bölüm
10).
Haploid bitki üretiminde anter (polen) ve yumurtalık (ovül)
kültürü:
Özellikle kendine döllenen bitkilerde yapılan klasik bitki
ıslahı melezlemeleri sonrası, hatların saflaştırılması (homozigotlaşması)
uzun zaman almaktadır. Mayoz bölünme geçirmiş haploid sayıda
kromozoma sahip hücrelerde (polen/mikrospor veya megaspor) veya
bu hücreleri ihtiva eden bitki kısımlarının (anter veya
yumurtalık) doku kültürü yoluyla elde edilen hücrelerinde veya
rejenerantlarında yapılan kromozom katlanması sonucu %100
homozigot bitkiler elde edilebilmektedir. Bu tekniğe
in vitro haploidi tekniği denir (Maheswari
ve ark., 1995) (bkz. Bitki Biyoteknolojisi Cilt I, Bölüm 5).
Somaklonal varyasyon:
Kallus oluşturan veya totipotent olup yeni bitkiler meydana
getirebilen hücreler uzun süreli kültürlerde veya kısa süreli de
olsa yüksek bitki büyüme düzenleyicileri içeren ortamlarda bu
yeteneklerini (kompotens) yitirebilmektedirler. Bu hücrelerden
oluşan yeni bitkilerde gen veya kromozom bozuklukları sonucu
kalıtsal ve fenotipik varyasyonlar (somaklonal varyasyon) ortaya
çıkmaktadır. Bu varyasyonlar, yeni çeşit geliştirme ve
iyileştirmelerde ıslahçılar tarafından kullanılmaktadır (Chrispeels
ve Sadava, 1994). Somaklonal varyasyon sonucu ortaya çıkan
değişiklikler arasında, bazı pigmentlerin yapısındaki
farklılaşmalar sonucu çiçek renginin, yaprak ve çiçek
morfolojisinin, tohum veriminin, bitki canlılığı ve iriliğinin,
uçucu yağ kompozisyonu ve hastalıklara tolerans veya
dayanıklılığın değişmesi sayılabilir (Brown ve Thorpe, 1995)
(bkz. Bitki Biyoteknolojisi Cilt I, Bölüm 11).
İn vitro seleksiyon:
Tek hücre seviyesinde; tuz, herbisitler, patojenler vb.
faktörlere karşı dayanıklılığa göre yapılan seleksiyonlar
sonucu, bu hücrelerden elde edilen bitkilerde ilgili faktörlere
dayanıklı veya toleranslı bitkiler ortaya çıkabilir. Bu tekniğe
in vitro seleksiyon denilmektedir.
İn
vitro
döllenme:
Bazı durumlarda (özellikle dış ortama alıştırılamayan
bitkilerden tohum almak için) doku kültürü ile elde edilen
bitkiler laboratuvar şartlarında tozlaştırılmaktadır. Fakat bu
uygulama çok sınırlı kalmıştır.
İn vitro
germplazm muhafazası:
Totipotent hücrelerin in vitro kültürü, kallus veya süspansiyon hücreleri şeklinde uzun
süreli olarak veya belirli aralıklarla yeniden oluşturularak
saklanabilir ve ihtiyaç duyulduğunda bu hücrelerden yeni
bitkiler oluşturulabilir. Alternatif olarak ilgili hücreler,
meristemler veya elde edilen minyatür bitkiler düşük sıcaklıkta
(4 0C), çok az besin maddesine ve alana ihtiyaç
göstererek aseptik şartlarda saklanabilir (1-4 yıl). Benzer
şekilde çok düşük sıcaklıklarda –196 0C), sıvı azot
içinde doku ve hücreler hızlı bir şekilde dondurulup
saklanabilirler. Bu doku kültürü teknikleri
in vitro
germplazm muhafazasında önemlidir ve gen ve tohum bankalarına
alternatif oluşturmaktadır (Brown ve Thorpe, 1995) (bkz. Bitki
Biyoteknolojisi Cilt I, Bölüm 9).
Somatik hücre melezlemesi (protoplast füzyonu):
Protoplast füzyonu ve somatik melezleme, pre-zigotik eşeysel
uyuşmazlıklar nedeniyle, klasik melezleme ile elde edilemeyen
hibritlerin elde edilmesinde kimyasal ve fiziksel metotlar
kullanılarak uygulanan bir tekniktir. Elde edilen somatik melez
hücreden (heterokaryon),
kallus oluşumu ve bitki rejenerasyonu yoluyla yeni bitkilerin
elde edilmesi sistemin en önemli ve en gerekli parçasıdır. Bu
işlem genel anlamda genetik kopyalamadır ve bitkilerde yaklaşık
30 yıldan beri uygulanmakta olup en başarılı örneği tütün
bitkisinde görülmüştür (Ochatt ve Power, 1992) (bkz. Bitki
Biyoteknolojisi Cilt I, Bölüm 4).
Gen transferi:
Doku kültürlerinin bitkileri iyileştirmede en önemli ve yaygın
olarak kullanılan uygulamalarından birisi de, gen veya genlerin
bitkilere aktarılmasıdır. Bunun için mutlaka tekrarlanabilir bir
hücre-bitki rejenerasyonu (organogenesis ve somatik
embriyogenesis) sistemine ihtiyaç vardır (bkz. Bitki
Biyoteknolojisi Cilt I, Bölüm 2, 3 ve 4).
Bitki doku kültürünün ticari ve ıslah dışı uygulamaları
Hastalıksız bitki elde edilmesinde meristem kültürü:
Tüm apikal meristem veya buradan alınan küçük embriyonik
parçalar kültüre alınarak uygulanan tekniğe meristem kültürü
denir. Çok az miktarlarda bitki büyüme düzenleyicileri ilave
edildiğinde uç ve yan meristemlerden birçok yeni bitkicikler
elde edilebilmektedir. Bu metotla elde edilen bitkiler her
bakımdan birbirinin benzeridirler (bkz. Bitki Biyoteknolojisi
Cilt I, Bölüm 6).
Mikroçoğaltım: Organize meristemlerden, henüz olgunlaşmamış veya olgunlaşmasını tamamlamış somatik hücrelerden direkt (organogenesis veya somatik embriyogenesis) veya indirekt (kallus, protoplast vb.) yollarla bitkilerin çoğaltılması ve köklendirilmesi işlemine genel olarak mikroçoğaltım denilmektedir. ABD'de doku kültürünün ticari uygulaması 1970' de başlamış (orkidelerde ve süs bitkilerinde) ve bu yolla elde edilen ürünlerin pazar değeri bu gün yılda 15 milyar dolara ulaşmıştır. Daha az sürgün elde edilmesine rağmen uç ve yan meristemlerden kitle çoğaltım ticari olarak diğerlerinden daha fazla kullanılan bir metottur (Brown ve Thorpe, 1995) (bkz. Bitki Biyoteknolojisi Cilt I, Bölüm 8). Aşağıda bir videoda ticari doku kültürü üretim laboratuvarından görüntüler vardır. Benzer konularda diğer videolar da görülebilir. Tüm çalışmalar steril şartlarda laminar hava akışlı kabin içinde yapılmaktadır.
Sentetik tohum üretimi (somatik embriyolar):
Somatik embriyoların çeşitli metotlarla kaplanması sonucu
sentetik (yapay)
tohumlar elde edilmektedir. Sentetik tohumların,
hibritlerin somatik çoğaltımında, erkısır ve ebeveyn hatların
muhafazasında ve odunsu bitkilerin elit genotiplerinin elde
tutulmasında kullanımı konusunda oldukça fazla çalışma
yapılmaktadır.
Sekonder metabolit üretimi (kallus-hücre süspansiyonları):
İn vitro
hücre kültürleri sekonder metabolit üretiminde de önemli bir
kaynak olarak görülmektedir. Bitki sekonder metabolitleri, bitki
büyüme ve gelişmesinde doğrudan kullanılmayan maddelerdir. Işık
mikroskobu ile görülebilen sekonder metabolitlerin (tanenler,
antosiyaninler, karetenoitler) yanında UV ışığı ile
görülebilenleri (alkaloitler) de vardır. Son yıllarda sekonder
metabolit üretimi için ot verimi yüksek, çok yıllık, geniş
adaptasyon kabiliyetine sahip ve azotlu gübre kullanımı oldukça
az olan yonca, alternatif bir bitki olarak gösterilmektedir.
İlgili enzim alındıktan sonra yoncanın geriye kalan kısmı ot
olarak kullanılabilir (Austin, 1997) (bkz. Bitki Biyoteknolojisi
Cilt I, Bölüm 7).
Kimeralar:
Doku kültüründe, özellikle süs bitkilerinde üzerinde önemle
durulan konulardan birisi de
kimeralardır. Kimerik bitkiler; farklı türlerin protoplastlarının
karışık kültürü ve bitki rejenerasyonu, mutasyon uygulamaları
sonucu bitki rejenerasyonu çalışmaları, apikal meristemle ilgili
yapılan mikro-cerrahi çalışmaları ve gen transferi yapılması
sırasında, bir bitkiyi oluşturan bütün hücrelerin ilgili gen
veya genleri taşımaması durumlarında (özellikle partikül
bombardımanı metodu ve apikal meristemler kullanıldığında) elde
edilebilmektedir.
Bitki doku kültürlerinin temel araştırmalardaki uygulamaları Doku kültürü, protoplast izolasyonu ve füzyonu, hücre, doku ve bitki beslenmesi, sitogenetik çalışmalar, morfogenesis çalışmaları ve biyolojik azot fiksasyonu gibi temel araştırmalarda da kullanılmaktadır. Bu tür araştırmalar genellikle sistem geliştirmede faydalı olmaktadır.
Doku Kültüründe
Temel Teknikler
Doku kültürü işlemleri bir
çok aşamadan oluşmaktadır. Bunlar: 1) Uygun bir laboratuvar
düzeninin kurulması, 2) Kullanılacak bitki parçalarının (eksplant)
ve besin ortamlarının seçimi, hazırlanması ve sterilizasyonu, 3)
Kallus ve hücre süspansiyonlarının oluşturulması, 4) Kallus veya
hücre süspansiyonlarından veya doğrudan somatik veya gametik
hücrelerden bitki rejenerasyonunun uyarılması (organogenesis,
somatik embriyogenesis veya meristem çoğaltımı yoluyla), 5)
Oluşan sürgünlerin çoğaltılması ve boylarının uzatılması,
somatik embriyoların olgunlaştırılması, 6) Uzayan sürgünlerin
köklendirilmesi, 7) Köklenen bitkilerin dış ortama alıştırılması
(aklimatizasyon).
Bunlar arasında en önemlisi, uygun laboratuvar imkanlarının
sağlanmasıdır.
Tablo: Bir laboratuvarda bulunması
gerekli olan imkanlar (Smith, 1992; Gamborg ve Phillips, 1995).
Babaoğlu ve ark., 2001-Bitki
Biyoteknolojisi Cilt I-Doku Kültürü ve Uygulamaları- Bölüm 1.
Temel Laboratuvar Teknikleri).
Bitki Doku kültürü ve geleceği ile ilgili bir yayın
(M. Babaoğlu, 1998)
Evde ve Okullarda hobi amaçlı doku kültürü yapmak isteyenlere Evde ve Okullarda Hobi Amaçlı Bitki Doku Kültürü pdf dosyası (Türkçe) (Bu makale Ticaret Borsası ve Biyotek Dergilerinde yayınlanmış, ayrıca bir çok web sitesinde yer almaktadır). Burada amacımız özellikle ilk ve ortaöğretim okullarında ve evlerinde doku kültürüne merakı olanlara bazı pratik bilgiler vermekti).
Evde Doku Kültürü Video (YouTube) İngilizce)
Mikroçoğaltımla (doku kültürüyle bitki çoğaltımı) ilgili çok
güzel bir video (YouTube) (İngilizce)
Diğer videolar (Hepsi çok güzel)
Bitkilerin doku kültürüyle çoğaltılmasını gösteren bir video
(YouTube) (İngilizce)
Doku kültürü I video (YouTube) (İngilizce)
Doku kültürü II Kısım video (YouTube) (İngilizce)
Doku kültürü III Kısım Kısım video (YouTube) (İngilizce)
Neden doku kültürü- mikroçoğaltımla ilgili bir video (YouTube)
(İngilizce)
Embriyo kültürü video (YouTube) (İngilizce)
Su Kültürlerinde Bitki Klonlama (Çoğaltma) Tohum gelişimi ve hormonlarla ilgili bir video (YouTube) (İngilizce) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||